Кафедра организована в 1921 году. Организатором и первым заведующим был А. Т. Лидский, видный советский хирург, заслуженный деятель науки, член-корреспондент АМН СССР. Окончил Казанский университет в 1914 г. В 1918-21 гг. заведовал кафедрой нормальной анатомии Астраханского медицинского института, а с 1921 по 1930 гг. – зав. кафедрой хирургии Астраханского мединститута. Он опубликовал свыше 90 научных работ, в том числе 7 монографий, является автором оригинальных операций (артродез голеностопного сустава, позадилонная внепузырная простатэктомия, операция восстановления тазового дна и другие). В годы Великой Отечественной войны опубликовал ряд работ по лечению ранений в госпиталях тыла (удаление инородных тел сердца, хирургия фантомных болей, лечение ранений крупных сосудов, вопросы восстановительной хирургии и др.). А. Т. Лидский является почётным членом Ленинградского хирургического общества им. Пирогова и Астраханского хирургического общества

В последующие годы заведующими кафедрой госпитальной хирургии были:

  • профессор Е. Л. Берёзов (1925-1932 гг.),
  • профессор А. Г. Бржозовский (1932-1935 гг.),
  • профессор А. Е. Мельников (1935-1936 гг.),
  • доцент В. И. Никифоров (1936 г.),
  • профессор В. М. Баль (1936-1965 гг.),
  • профессор В. Б. Сучков (1965-1966 гг.),
  • профессор В. Г. Вальтер (1966-1991 гг.).
  • профессор В. Е. Кутуков (1991-2001 гг.)

В разные годы на кафедре трудились доценты:

  • доцент В. И. Вилявин (1925-1938 гг.),
  • доцент В. П. Березенцев (1929-1963 гг.),
  • доцент Б. М. Хромов (1942-1953 гг.),
  • доцент А. И. Богатов (1946-1951 гг.),
  • доцент Ф. Ф. Белоярцев (1960-1977 гг.),
  • доцент Ю. Ф. Чичков (1966-1974 гг.),
  • доцент Н.Е.Фетисов (1972 г.),
  • доцент А. С. Арапов ,

ассистенты:

  • 3. М. Решетникова,
  • Г. С. Масленников,
  • О. В. Собгайда,
  • Ю. И. Кузнецов.

Такие учёные, бывшие заведующие кафедрой, как А. Т. Лидский, Е. Л. Берёзов, А. Г. Бржозовский являются учёными с мировым именем, авторами многочисленных монографий, руководств, учебников.

Е. Л. Берёзов – заслуженный деятель науки РСФСР, ученик С. И. Спасокукоцкого и П. А. Герцена. С 1925 по 1932 гг. – профессор хирургии Астраханского мединститута – автор 160 научных работ, в том числе 8 монографий, главным образом по вопросам хирургии язвенной болезни желудка и пищевода.

В 1936 году заведующим кафедрой был утверждён профессор В. М. Баль, заслуженный деятель науки РСФСР, который руководил кафедрой до 1965 года. Научно-исследовательская работа проводилась в области желудочной хирургии. Профессор В. М. Баль и доцент В. П. Березенцев, работая в военных госпиталях города, одновременно обеспечивали и учебно-педагогический процесс. В послевоенный период кафедра была укомплектована квалифицированными кадрами, среди которых доценты: А. М. Фалькович – курс стоматологии, Н. Г. Лычманов – ортопедия, А. И. Богатое – курс военно-полевой хирургии. Н. Г. Лычманов в дальнейшем стал заведующим кафедрой оперативной хирургии, а А. И. Богатов – заведующим кафедрой факультетской хирургии, где под его руководством в Астраханской области стала развиваться грудная и сердечно-сосудистая хирургия.

С 1965 по 1966 гг. кафедрой заведовал В. Б. Сучков, профессор, заслуженный деятель науки Калмыцкой АССР, впоследствии заведующий кафедрой оперативной хирургии и топографической анатомии, ректор Астраханского медицинского института. В. Б. Сучков – автор 150 научных работ по вопросам организации здравоохранения, учебного процесса, хирургии, стерилизации и консервировании тканей. За заслуги перед наукой награждён 3 орденами и 10 медалями, в т. ч. Советского Комитета защиты Мира и Советского Фонда Мира.

Основным направлением научной деятельности кафедры в этот период являлась проблема экспериментальной и клинической хирургии желудка.

С 1966 года кафедру госпитальной хирургии возглавил профессор В. Г. Вальтер, проработавший в этой должности до 1991 г. За это время была создана школа астраханских хирургов, основным направлением которой стала хирургия язвенной болезни желудка и 12-перстной кишки.

В. Г. Вальтер был автором более 200 научных работ, в том числе 8 изобретений и более 50 рацпредложений отраслевого и местного значения. Им разработаны оригинальные способы резекции желудка, создание «искусственного желудка», названное его именем, три способа обработки культи двенадцатиперстной кишки при резекции желудка, пластический способ ушивания перфоративных гастродуоденальных язв, укрепления пищеводно-кишечных, пищеводно-желудочных и толстокишечных анастомозов, способ наложения гастроэнтероанастомоза, кардио- и пилоропластики, способ панкреатодуоденальной резекции и др. Под редакцией профессора В. Г. Вальтера изданы 2 монографии и 3 сборника научных работ. За заслуги в развитии восстановительной хирургии награждён золотой медалью им. Н. А. Богораза, бронзовой медалью ВДНХ СССР. В 1995 году решением Ученого совета Астраханской государственной медицинской академии ему было присвоено Почетное звание «Заслуженный профессор АГМА».За большой вклад в отечественную хирургию Указом Президента Российской Федерации от 21 ноября 1995 года профессору Вальтеру Виталию Григорьевичу присвоено Почетное звание Заслуженный деятель науки РФ. Профессором В. Г. Вальтером и его учениками разработаны и усовершенствованы способы резекции желудка, а также большое количество оригинальных хирургических методик использования желудочного трансплантата в качестве универсального пластического материала в абдоминальной хирургии, урологии, а также лёгких, сердца и аорты в эксперименте. Под руководством В. Г. Вальтера выпущено 42 кандидатских и 9 докторских диссертаций, посвящённых преимущественно вопросам хирургии органов пищеварительного тракта.

После перехода профессора В. Г. Вальтера на кафедру хирургических болезней ФПО заведующим кафедрой стал профессор В. Е. Кутуков. Под его руководством продолжена работа по хирургии язвенной болезни и её осложнений, разработан и внедрён ряд современных медицинских технологий в неотложной и плановой хирургии. Широко внедрён комплекс активных хирургических и реаниматологических мероприятий при острой абдоминальной патологии, осложнённой перитонитом: программированные этапные санации брюшной полости, дифференцированный выбор способа декомпрессии ЖКТ при перитоните и острой кишечной непроходимости, способ временной герметизации брюшной полости при её этапных санациях, способы раннего иммунологического прогнозирования гнойных осложнений. Активно внедрены методы экстракорпоральной детоксикации и ГБО при перитоните и панкреонекрозе.

С 1998 г. на базе хирургического отделения НПМК “Экологическая медицина” впервые стали выполняться видеолапароскопические оперативные вмешательства, среди которых впервые в г. Астрахани выполнена резекция сигмовидной кишки, адгезиолиз при спаечной болезни, лапароскопическое устранение рецидивной грыжи.

С 1998 г. стали широко применяться новые для нашего региона современные способы оперативного лечения паховых и послеоперационных грыж. Изобретён способ резекции желудка с клапанным анастомозом. Под руководством В. Е. Кутукова защищено 9 кандидатских диссертаций.

С 2001 г. по настоящее время кафедру возглавляет профессор Ю. В. Кучин. Под его руководством продолжается активное внедрение эндовидеохирургии и миниинвазивных методик при абдоминальной патологии. Защищены 6 кандидатские диссертации и выполняются диссертационные работы.

Усовершенствован комплексный подход к лечению больных панкреонекрозом, стали более широко выполняться радикальные оперативные вмешательства при опухолях и фиброзно-кистозном перерождении железы: панкреатодуоденальная резекция и резекция тела и хвоста поджелудочной железы.

С 2015 г. Клинической базой кафедры стала ГБУЗ АО АМОКБ