Основными направлениями научной работы кафедры являются: внедрение торакотомических доступов при операциях на сердце у детей» (д.м.н., профессор А.А. Шмальц), внедрение миниинвазивных доступов впрактику кардиохирургии (зав. хирургическим отделением, к.м.н. Чернов И.И., главный врач Центра сердечно-сосудистой хирургии Совместно с врачами Центра выпускается большое количество научных работ: публикаций, тезисов, монографий.