Кафедра физического воспитания как самостоятельное подразделение медицинского института организована в 1932 году. Первым ее заведующим был А.П. Касьянов, проработавший на этой должности до 1942 года, то есть до времени начала эвакуации ВУЗа в г. Барнаул, когда он был призван в ряды Советской Армии. Участвовал в боевых действиях (погиб в 1944 году).

В довоенный период основной задачей кафедры было сохранение и укрепление здоровья студентов в плане физической подготовки не только для будущей медицинской профессии, но и к службе в Вооруженных Силах страны. После окончания Великой Отечественной войны на занятиях по физической культуре кафедрой придавалось значение  развитию массовых видов спорта с сохранением традиционных принципов оздоровления студентов и преподавателей и проводимых в этом аспекте существенных организационных мероприятий.

С 1946 по 1953гг. кафедру возглавлял С.Б. Срода, внесший заметный вклад в дело развития физкультуры и спорта в институте.

С 1953г. наряду с регулярно осуществляемыми занятиями по физи-ческому воспитанию, под руководством зав. кафедрой Г.К. Ступина кафедра активно включилась совместно с кафедрой биологии АГМИ в научные исследования по изучению закономерностей физического развития и уровня состояния здоровья студентов на протяжении всего периода их обучения.

С 1956г. стала заведовать кафедрой В.И. Дельсаль, продолжившая опыт преподавания физической культуры, заложенный её предшественниками. Основные задачи кафедры были связаны с  подготовкой значкистов ГТО и развитием массовых видов спорта.

С приходом в 1961 году в качестве заведующего, мастера спорта СССР И.А. Коломейцева кафедра и спортклуб ВУЗа (председатель мастер спорта СССР Н.В. Яньшин), помимо широкой пропаганды и реализации программы физической культуры как обязательной учебной дисциплины, стали добиваться наивысших результатов по подготовке спортсменов высокого класса. Начиная с этого периода и в последующем уделялось должное внимание не только физическому воспитанию обучаемых на всех курсах и факультетах ВУЗа, но и подготовке рекордсменов, победителей и призеров чемпионатов и первенства Астраханской области, Облсовета ДСО “Буревестник”, Российского и Центрального Советов “Буревестник”, РСФСР и СССР по различным видам спорта: боксу, тяжелой атлетике, волейболу, ритмической гимнастике, легкой атлетике, плаванию. В те годы рекордсменом и чемпионом Советского Союза по легкой атлетике стал студент А.С. Тарасьян (тренер ст. преподаватель З.Т. Давыдов); студент А. Бунтов (тренер ст. преподаватель Б.Д. Дынкин) – призером СССР и РСФСР по легкой атлетике среди юниоров; мастерами спорта СССР стали: по боксу – студент А. Зулькафиев (тренер ст. преподаватель П.Н. Хорошун); по тяжелой атлетике – М. Каширский, А. Шахтаев, С. Куликов, П. Ефремов, С. Гринько (тренер  ст. преподаватель Э.М. Батырев); по велоспорту – доцент Ю.И. Филимонов.

Преподаватели кафедры активно участвовали в судействе соревнований различного масштаба. Так, доцент Ю.И. Филимонов и  ст. преподаватель Б.Д. Дынкин удостоились права быть судьями 22-х Олимпийских игр в г. Москве (1980г.), получив звание судей международной категории. Ст. преподаватель, дважды мастер спорта СССР, А.И. Коломейцева имела статус судьи Всесоюзной категории, а “Судьями Республиканской категории” были И.А. Коломейцев, Э.М. Батырев, А.Ф. Шевелькова, Н.В. Яньшин, В.А. Жиганова, Г.М. Громова, А.Н. Маргалик, П.Н. Хорошун, Е.П. Скородумов, С.Б. Срода, А.Б. Украинский, З.Т. Давыдов, В.М. Михайленя, Ш.Х.Калиев.

В 1987г. произошло в вузе объединение кафедры физвоспитания с кафедрой Врачебного контроля и лечебной физкультуры, которую возглавил доцент Ю.И. Филимонов. С 1989 по 1992 гг. этой кафедрой заведовал мастер спорта СССР, доцент А.А. Ушаков.

В 1992 г. кафедра физического воспитания вновь становится самостоятельным подразделением вуза, заведующим назначен доцент АГМА Э.М. Батырев. С его приходом на кафедре стала более широко проводиться научно-исследовательская работа. За этот период преподавателями кафедры опубликовано более 50 печатных научных трудов, результаты которых используются в качестве методических рекомендаций для улучшения физического состояния и качества подготовки будущих врачей и внедрены в медицинскую, педагогическую и спортивную практику. В 2006 г. А.В. Доронцев защитил диссертацию и стал кандидатом педагогический наук, а в 2007г. доцентом. Семь преподавателей награждены знаком “Отличник ФК и спорта” (Э.М. Батырев, Х.М. Батырев, Л.В. Бажанова, А.В. Доронцев, С.Ю. Попов, И.М. Акиншин, Н.Ю. Токарчук). В 2007 г. Э.М. Батыреву присуждено звание “Заслуженного работника физической культуры РФ”. Продолжается подготовка спортсменов высокого класса. Ст. преподаватель С.Ю. Попов является тренером сборной России и членом Исполкома Федерации по бодибилдингу и фитнесу России,  судьей международной категории, тренером высшей категории. Им и преподавателем кафедры Х.М. Батыревым в последние годы подготовлены: мастер спорта России, 2-кр. бронзовый призер чемпионата и Кубка России по фитнесу А. Кочкина; мастер спорта России международного класса, 2-кр. вице-чемпион мира, 2-кр. чемпион России и Кубка России по бодибилдингу М. Никотина; мастер спорта России, 2-кр. бронзовый призер чемпионата Кубка России по фитнесу И. Воробьева.

В 2012 году Министерство здравоохранения РФ организовывает фестиваль спорта среди медицинских и фармацевтических Вузов России под девизом « Физическая культура и спорт – вторая профессия врача» сборная команда нашего вуза становилась многократным победителем и призером фестиваля спорта;

Чемпионами по студенческому многоборью в 2012 – 2013 г.г. становилась КМС по многоборью студентка педиатрического факультета Циглер Олеся и  студент лечебного факультета КМС по многоборью Рабаданов Рамазан.

Чемпионом по плаванию на дистанции 50 м. баттерфляем в 2013 году стал студент лечебного факультета Вознюк Максим, а сборная команда по студенческому волейболу ( тренер Махмутов К.А.) в 2013 году вышла в финал соревнований МЗ России.

С 2013 г. кафедру возглавляет к. п. н., доцент Доронцев А. В.

В 2014 году сборная команда университета по баскетболу (юноши) тренер Махмутов К.А. становятся победителями соревнований среди медицинских и фармацевтических вузов ЮФО в г. Волгоград и завоевали путевку на финальный турнир МЗ России г. Санкт – Петербург. В этом же году сборная команда АГМА по легкой атлетике дважды занимает кубок г. Астрахани по легкоатлетической эстафеты. Сборная команда академии по 9 видам спорта становиться бронзовым призером фестиваля физической культуры и спорта «Физическая культура и спорт – вторая профессия врача» г. Волгоград.

В 2015 году по решению совета ректоров медицинских и фармацевтических вузов России возрождается спартакиада «Здоровье» среди профессорско – преподавательского состава вузов. По результатам спартакиады сборная команда АГМА становится бронзовым призером в комплексном зачете. В этом же году студентка 6 курса педиатрического факультета Циглер О. становится чемпионкой ЮФО по летнему комплексу ГТО среди медицинских и фармацевтических вузов (г.. Волгоград), студентка 1 курса педиатрического факультета Хасханова Фариза выигрывает чемпионат Мира по кик боксингу среди юниоров (г. Анапа).

В 2016 году  студент 6 курса педиатрического факультета становится золотым призером России по греплингу и выполняет норматив мастера спорта РФ. Студент 5 курса Хожджаев Турал становится чемпионом Мира по каратэ (г.Москва)  в этом же году ему присваивается звание «Мастер спорта международного класса». Алиев Камич, студент 4 курса стоматологического факультета выигрывает чемпионат России по джу – джитсу с присвоение звания «Мастер спорта РФ»

В 2017 году сборная команда университета в составе Акишкиной А., Избаева И.- студенты лечебного факультета и Лелековой А. преподавателя кафедры физической культуры впервые принимают участие в Медународном легкоатлетическом марафоне «Победа» г. Волгоград.

Студентка 1 курса лечебного факультета Доронцева К. становится победителем международного турнира  «Кубок Израиля» (г. Тель-Авив) по художественной гимнастике выполнив норматив мастера спорта РФ.

2017 год – 85 лет образования кафедры физической культуры на торжественном вечере открытия 85 спартакиады за многолетний и добросовестный труд были награждены грамотами ректората Астраханского ГМУ отличники физической культуры и спорта преподаватели кафедры физической культуры Попов С.Ю., Бажанова Л.В., Токарчук Н.Ю., Шевелькова А..Ф., Батырев Х.М.

2018 год  Сборная команда профессорско – преподавательского состава университета становится бронзовым призером к общем зачете на спартакиаде «Здоровье» среди медицинских и фармацевтических образовательных учреждений кластера «Южный» (г. Кранодар)  студент 2 курса лечебного факультета Ким В. в составе сборной России становится чемпионатом Мира по пейнт – болу (Франция), выполнив норматив мастера спорта РФ. Доронцева К.  мастер спорта студентка 2 леч. фак та стала пятикратной чемпионкой ЮФО по художественной гимнастике в составе сборной команды Астраханской области в групповых упражнениях(г.Сочи). Хасханова Ф. студентка 3 курса педиатрического факультета становится серебряным призером чемпионата Мира по кик боксингу среди женщин (г.Анапа).