Кафедра медицинской реабилитации создана в августе 1999 года и исходно относилась к факультету последипломного образования. Заведующим кафедрой избран по конкурсу кандидат медицинских наук  М.А. Орлов. Первыми штатными сотрудниками и ассистентами кафедры медицинской реабилитации становятся А.Л. Иванов, Л.М. Погребниченко, Е.И. Минеева, Ю.В. Кондрашова и Е.А. Липницкая. Позднее в коллектив кафедры вошли Е.М. Селезнева и М.М. Орлов, а Л.М. Погребниченко продолжила работу на кафедре госпитальной терапии. В альянсе с профессорско-преподавательским составом кафедры работают по настоящее время старший лаборант Л.Л. Оганисян – специалист по терапии, традиционной медицине, рефлексотерапии, гомеопатии и лаборант Э.С. Газизова, имеющая первую квалификационную категорию медицинской сестры по хирургии и ЛФК. В настоящее время  Екатерина Ивановна Минеева находится на заслуженном отдыхе, а Е.М. Селезнева и Е.А. Липницкая успешно работают в системе практического здравоохранения.

В 2010 году кафедра медицинской реабилитации реорганизовывается в кафедру восстановительной медицины и лечебной физической культуры. Продолжил руководство кафедрой доктор медицинских наук, профессор М.А. Орлов. Во вновь созданном коллективе стали работать бывшие сотрудники кафедры спортивной медицины, лечебной физкультуры и физиотерапии – доценты И.Н. Андреева, С.Н. Касаткин и ассистент О.В. Точилина. Слияние  двух кафедр потребовало актуальных изменений в основных направлениях научной, учебно-методической и клинической деятельности всех сотрудников. Приоритетными направлениями деятельности кафедры становятся обучение и совершенствование знаний студентов, ординаторов и слушателей циклов последипломного образования основным и частным вопросам восстановительного лечения, физиотерапии,  лечебной физкультуры и спортивной медицины.

В 2013 году кафедра восстановительной медицины и лечебной физической культуры вновь становится кафедрой медицинской реабилитации. Вместе с вышеназванными сотрудниками на кафедре стали работать в должности ассистентов Акишина И.В. и Касимова Н.М. В 2014 году к.м.н., доцент Касаткин С.Н. уволился с кафедры и полностью перешел на практическую работу.

Самостоятельная история кафедры лечебной физкультуры, спортивной медицины и физиотерапии начиналась с образования курса в 1950 году. Первыми ассистентами, преподававшими дисциплину «Врачебный контроль и лечебная физкультура», были Ступин Г.К. и Филимонов Ю.И.,  защитивший в  1967 году кандидатскую диссертацию. Вскоре Филимонов Ю.И. был переведен на должность доцента, а коллектив преподавателей пополнился ассистентами Ушаковым А.А., Заякиной И.Н., Аболиной Л.Н.,  Тепляковой Г.Н. В этом же коллективе стала работать старший лаборант (позднее ассистент) Зайцева С.Г. С 1978 года на курсе введено преподавание физиотерапии.

1980 год явился датой официального создания кафедры лечебной физкультуры, спортивной медицины и физиотерапии, а ее первым заведующим становится к.м.н., доцент Ю.И. Филимонов. Юрий Иванович возглавлял кафедру до 1991 года. Многие годы он руководил велоклубом, готовил команды и сам выступал в соревнованиях. Также являлся организатором и участником велопробегов различного уровня, включая международные (1983, 1986 г.г.).  Доцент Ю.И. Филимонов являлся мастером спорта СССР и судьей международной категории. За участие в Международных акциях Мира и XXII Олимпийских играх в Москве он был награжден Орденом Дружбы народов.

Основными научными направлениями тех лет явилось изучение состояния здоровья и физического развития школьников, студентов, рабочих промышленных предприятий, спортсменов. Успешно выполнялись хоздоговорные научные исследования на промышленных предприятиях города Астрахани и области. Кафедра участвовала в целевых программах МЗ РФСР «Здоровье студентов» и МЗ СССР «Студент». В 1983 году ассистент (позднее доцент) Л.Н. Аболина защитила  кандидатскую диссертацию, а ее плантоперфограф экспонировался на ВДНХ и был отмечен серебряной медалью. В тот же период сотрудники внедрили 5 научных изобретений.

С 1991 по 2001 годы кафедрой лечебной физкультуры, спортивной медицины и физиотерапии руководил  д.м.н., профессор А.А. Ушаков. Алексей Александрович удостоен званий мастера спорта, чемпиона СССР по гребле на каноэ. С 1995 года по 2004 годы он являлся главным внештатным специалистом  по спортивной медицине и лечебной физкультуре Департамента здравоохранения Астраханской области. В 1991 году основной базой кафедры становится студенческий профилакторий медицинской академии. Для оптимизации образовательной деятельности использовались хорошо оснащённые кабинеты физиотерапии, лечебной физкультуры и массажа, а также кабинеты функциональной диагностики, врачебного контроля и тренажерный зал. В 1993 году на кафедре введена специализация врачей по специальности «Лечебная физкультура и спортивная медицина», а с 1995 года  – по специальности «Физиотерапия».

Под руководством профессора А.А. Ушакова выполнены и успешно защищены кандидатские диссертации Болотниковым И.Ю., Михайловской И.В., Филимоновым Э.П., Симоновой Т.Н. В 2001 г. ассистент С.Н. Касаткин официально защитил кандидатскую диссертацию  на тему «Оптимизация патогенетической терапии астраханской риккетсиозной лихорадки».

С 2002 по 2010 годы заведующей кафедрой лечебной физкультуры, спортивной медицины и физиотерапии являлась к.м.н., доцент Андреева И.Н. В этот период на кафедре работали к.п.н., доцент Аболина Л.Н., к.м.н., доцент Касаткин С.Н., ассистенты Касимова Н.М., Точилина О.В., Шаронова А.Б. и старший лаборант Крайников С.Н. Осуществлялось  преподавание общей физиотерапии, врачебного контроля и лечебной физкультуры, реабилитологии. В основы научной работы кафедры положена разработка методов лечения с применением физических факторов и лечебной физкультуры, активно работал студенческий научный кружок. Общим итогом многолетней работы кафедры лечебной физкультуры, спортивной медицины и физиотерапии явились защита 1 докторской и 8 кандидатских диссертаций, публикации более 500 научных работ, 2 патента, 7 авторских свидетельств на изобретения и 29 рационализаторских предложений. Издано 13 методических пособий и 1 учебное пособие. В 2002 г. Касаткин С.Н. удостоен гранта администрации Астраханской области за разработку метода лечения астраханской риккетсиозной лихорадки.

В настоящее время в свете современных требований ФГОС кафедра медицинской реабилитации не только возвратилась к своему прежнему наименованию, но и осуществляет обучение студентов новой дисциплине – медицинской реабилитации. На регулярной основе проводятся циклы повышения квалификации врачей по направлению «Медицинская реабилитация», а также продолжаются циклы профессиональной переподготовки и повышения квалификации практикующих врачей по актуальным вопросам физиотерапии, лечебной физкультуры и спортивной медицины. Современная методология учебного процесса по вышеуказанным дисциплинам предусматривает приобретение практикующими врачами полезных знаний, умений и навыков в области комплементарной медицины, рефлексотерапии, лазеротерапии, гомеопатии, гирудотерапии, мануальной терапии и массажа. В этой связи сотрудники кафедры медицинской реабилитации сами являются высококвалифицированными специалистами в различных клинических дисциплинах.

В общей сложности сотрудниками кафедры медицинской реабилитации только за последние 5 лет опубликовано более 100 научных трудов, включая учебно-методические пособия, монографии и патенты. После 2005 года на кафедре успешно защищены одна докторская (М.А. Орлов) и  шесть кандидатских диссертаций (Е.А. Липницкая, А.Л. Иванов, Ю.В. Кондрашова, В.А. Кудрявцев, М.М. Орлов, О.В. Точилина).  Продолжается работа на докторскими (И.Н. Андреева, М.М. Орлов, А.Л. Иванов) и кандидатскими (И.В. Акишина, Н.Ф. Баркова) диссертациями. Кандидатам медицинских наук И.Н. Андреевой, С.Н. Касаткину,  М.М. Орлову, А.Л. Иванову присвоено ученое звание доцента.

Все сотрудники кафедры принимают активное участие в работе научных форумов, конференций и обществ, имеют устойчивую публикационную активность, а также укрепляют связи с практическим здравоохранением.  В настоящее время отличник здравоохранения, профессор М.А. Орлов является экспертом Росздравнадзора и качества медицинской помощи по Астраханской области и экспертом регионального Минздрава. Отличник здравоохранения, доцент  И.Н. Андреева длительное время является председателем Астраханского областного научного медицинского общества врачей физиотерапевтов.  Доцент С.Н. Касаткин возглавлял Астраханское областное научное медицинское общество врачей лечебной физкультуры и спортивной медицины. Большинство сотрудников работают на клинических базах кафедры консультантами и совместителями по основной специальности.