С момента создания естественно-научного факультета в составе Астраханского университета в 1918 году патологическая физиология преподавалась в курсе общей патологии (зав. – профессор И.П. Васильев). Как самостоятельная кафедра патофизиологии существует с 1924 года. Возглавил ее профессор Евгений Николаевич Коган (ученик академика А.А. Богомольца). Наряду с хорошо организованным учебным процессом в тот период проводились интенсивные научные исследования. Их тематика была достаточно разнообразна: исследование патогенеза лихорадки, опухолевого роста, нарушение внешнего и внутреннего дыхания, по материалам которых было опубликовано 14 научных работ. Е.Н.Коганом были написаны главы учебника по патологической физиологии под редакцией академика А.А. Богомольца.

С 1930 по 1936 годы кафедрой заведовал (по совместительству) физиолог, профессор В.В. Петровский.

Значительный период жизни кафедры связан с именем профессора И.В. Колпакова, руководившего ею в течение 23-х лет (1936- 1959 гг.) и внесшего неоценимый вклад в развитие науки. Ведущим научным направлением было изучение реактивности организма (в частности, аллергической); интересными были исследования по патогенезу радиобиологического эффекта. Под его руководством было защищено 7 кандидатских диссертаций.

В годы Великой Отечественной войны, в период эвакуации в г. Куйбышев, а затем в г. Барнаул на кафедре не прекращались ни учебный процесс, ни научные исследования.

По материалам наблюдений за ранеными в эвакогоспиталях под руководством профессора И.В. Колпакова выполнены научные работы: «О внутримышечном применении витаминизированного жира рыб Волго-Каспийского бассейна», «Цитологический анализ раневых экссудатов при лечении чудесной палочкой гнойных осложнений ран мягких тканей».

После переезда профессора И.В.Колпакова в г. Куйбышев кафедрой заведовал профессор В.В. Михайлов (1960-1962 гг.) ученик академика А.Д. Адо. Научное направление кафедры – выяснение механизмов инфекционного процесса. Под руководством профессора В.В. Михайлова выполнено 5 кандидатских диссертаций.

Изучение патогенеза инфекционного процесса продолжалось и в период заведования кафедрой доцентом А.В. Утюмовой-Маловой (1962-1967 гг.).

В 1967 году кафедру возглавила профессор И.П. Гаранина- представитель школы академика Н.Н. Сиротинина и академика А.Д. Адо. Научные исследования касались механизмов развития нарушений дыхания, деятельности сердечно-сосудистой системы, кишечника, изменения уровня биологически активных веществ при действии токсинов стафилококков, дифтерийной, дизентерийной и кишечной палочек.

Результаты научных исследований были обобщены в 3-х тематических сборниках, выпущенных под редакцией профессора И.П. Гараниной, и в ее актовой речи «Патофизиологические аспекты действия бактериальных токсинов», прочитанной в Астраханском мединституте 14 ноября 1984 года. Под ее руководством выполнены 1 докторская и 16 кандидатских диссертаций. Ею написаны некоторые главы учебника «Патологическая физиология» (1973-1980 гг.), вышедшего в издательстве «Медицина» под редакцией академика А.Д. Адо. Профессор И.П. Гаранина возглавляла Астраханское городское общество патофизиологов, являлась членом правления Всесоюзного общества патофизиологов.

С ноября 1991 года кафедрой руководила профессор Н.К.Первухина, выпускница АГМИ. Защитив досрочно в 1964 году кандидатскую диссертацию «К механизму нарушений концентрационной и очистительной способности почек при дифтерии и ботулизме», работала ассистентом кафедры до 1971 года. Тема ее докторской диссертации – «Роль нарушения баланса медиаторов вегетативной нервной системы при бактериальных воздействиях на организм» (клинико-экспериментальное исследование). Профессор Н.К. Первухина — автор 117 научных работ, 1 авторского свидетельства, награждена медалью «Изобретатель СССР» и знаком «Отличник здравоохранения». К сожалению, профессор Н.К. Первухина скоропостижно скончалась в 1995 году.

В 1997 году на заведование кафедрой избран доктор медицинских наук Н.Н. Тризно, питомец АГМА.  В 1996 году он защитил докторскую диссертацию на тему: «Эколого-физиологические механизмы токсического отека легких при ингаляции сероводородсодержащего газа». Им опубликовано свыше 100 научных работ. Он соавтор двух монографий: «Экологические аспекты генеза токсического отека легких» (1996), «Токсический отек легких при остром отравлении сероводородсодержащим газом» (2000). Под его руководством  выполнены и выполняются кандидатские и докторские диссертации.

В 2009 году приказом ректора кафедра патологической физиологии была объединена с кафедрой патологической анатомии и получила название «Общей патологии». В 2010 году было восстановлено статус-кво и таком виде кафедра патологической физиологии  существует до настоящего времени.

Многие студенты-кружковцы и аспиранты получили на кафедре «путевку» в науку. Так, бывший аспирант кафедры- профессор Ю.С.Татаринов много лет был ректором АГМИ и возглавлял кафедру биохимии; в последующем – академик Российской Академии Естественных наук, зав. кафедрой биохимии Российского медицинского университета, профессором этой кафедры являлся С.К. Кривоносов (бывший студент-кружковец).

Кафедрой биохимии АГМИ заведовала профессор А.В.Афанасьева (бывший аспирант). Кафедру пропедевтики детских болезней несколько лет возглавлял доцент А.Р. Колоколов (бывший кружковец). В Астраханском государственном университете заведует кафедрой анатомии и физиологии профессор Д.Л. Теплый (бывший старший лаборант кафедры патофизиологии), доцентом работает Л.М. Мяснянкина и профессор Н.А. Горст (диссертанты профессора И.П. Гараниной). В летопись кафедры навечно вписаны имена сотрудников, которые практически всю свою жизнь плодотворно трудились в ее стенах. Это профессор А.В. Утюмова- Малова, профессор Д.Л.Теплый, ассистент, канд. мед. наук В.И.Ходос, а также В.В.Буков, И.И. Смирнов, и другие.

За время существования кафедры защищено: 3 докторские и 28 кандидатских диссертаций, издано 3 сборника научных трудов, 4 монографии,  опубликовано 618 научных статей, девятнадцать  методических пособий, получено одно авторское свидетельство, 20 рационализаторских предложений.

Научное направление кафедры сегодня – это экологические проблемы Астраханского региона: изучение механизмов, а также поиск возможных путей коррекции метаболических сдвигов при воздействии на организм природного серосодержащего газа.